1、開票方丟失專票，且發票為空白發票，尚未開具：開票方需要根據相關流程對丟失發票進行“報失”，由稅務機關發布“遺失聲明”，企業需要承擔相關的費用與處罰等。
2、開票方丟失已開具的專票：開票方先進行納稅申報，再向主管稅務申請出具“丟失增值稅專用發票已報稅證明單“，最后將該證明和丟失發票的記賬聯復印件交收票方，這樣收票方可以進行正常認證抵扣。
3、開票方丟失已開具的專票，但僅丟失抵扣聯：開票方將未丟失聯次交給收票方，收票方可到主管稅務進行認證抵扣。開票方留存復印件備查。
4、收票方丟失專票，專票已認證：收票方如要正常抵扣，需要由開票方提供該發票記賬聯復印件，以及主管稅務出具的“丟失增值稅專用發票已報稅證明單”。收票方依據上述兩項文件向主管稅務申請，待審核同意后，可進行進項稅抵扣。
5、收票方丟失專票，專票尚未認證：同樣，需要開票方提供該張發票記賬聯復印件以及“丟失增值稅專用發票已報稅證明單”。收票方先到稅局進行認證，認證相符后，經主管稅務審核同意后，可進行進項稅抵扣。
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